A crise econômica fez disparar a inadimplência em financiamentos do BNDES. Em seu balanço de 2016, o banco informa que 2,81% de sua carteira de crédito está com inadimplência superior a 30 dias. Em 2015, o índice era de apenas 0,06%. Devedores sem pagar há mais de 90 dias equivalem a 2,43% da carteira, contra 0,02% registrados no final do ano anterior. O aumento da inadimplência e a piora na classificação de risco das empresas tomadoras de empréstimos obrigaram o banco a sextuplicar suas provisões para risco de crédito, que chegaram a R$ 9,156 bilhões no fim de 2016.